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本協會之宗旨任務如下:

  • 沿海國漁業合作之規劃、研究、推動、交涉、及談判事項。
  • 國際漁業合作之規劃、分析及參與事項。
  • 漁船暨船員在國外遭難、被扣事件之交涉與訴訟協助事項及船員遣返事項。
  • 遭難、被扣漁船之船員在國外訴訟期間生活費用及訴訟費用之墊借或補助事項。
  • 遠洋漁業漁獲資料之蒐集、彙整、統計及資料庫維護事項。
  • 漁船監控系統之規劃、執行與推動事項。
  • 接受政府委辦之有關漁業事項,如辦理觀察員計畫等。